2006年1月，经国务院批准，国证监会正式批复，同意中关村科技园区非上市股份有限公司进入证券公司代办股份转让系统进行股份转让试点，非上市股份有限公司代办股份转让系统（简称“新三板”），中关村有幸成为“新三板”第一个试点园区。当“新三板”将面向国家高新区扩大试点的消息传出后，各地高新区的反应异常活跃，不约而同地加快了步伐，希望成为“新三板”试点之一。

        目前的三板市场起源于2001年。早在2001年7月16日，三板市场已经成立。该市场依托深圳证券交易所和中央登记结算公司的技术系统运行，由证券公司代理买卖挂牌公司股份。那时的三板市场一方面为退市后的上市公司股份转让提供继续流通的场所，另一方面也解决了原STAQ、NET系统历史遗留的数家公司法人股流通问题。但这也让三板市场获得了“垃圾桶”的称号，以至于后来几乎从人们的视野中消失。后来，中国证监会决定，中关村科技园区非上市股份公司从2006年1月开始进入代办转让系统进行股份报价转让，至此，“新三板”作为三板市场的一部分，开始吸引众多科技型中小企业的关注。

        “新三板”建立之初的定位是为高速成长的科技型中小企业提供投融资服务，以及成为证券公司代办转让系统、未来的创业板市场甚至主板市场的优质企业蓄水池。“新三板”成立之初存在一定缺陷，如交易方式过于呆板，没有体现融资的功能；交易结算单一，导致一些企业持观望态度等。

        为了妥善解决这些问题，2006年 10月14日，“新三板”第五次五方联席会议在深圳召开，会议决定对“新三板”进行改革，一是有限责任公司改制成股份有限公司之后，不用再等一年，可以直接进入“新三板”。二是简化挂牌企业定向增发的程序，只要券商和定向私募的企业双方认可，中国证券业协会备案即可。此外，在结算银行、结算方式等方面也进行了调整。

        在目前我国证券市场的大格局中，上海主板市场和深圳中小板市场已经初具规模，但是作为我国多层次资本市场体系的重要组成部分，如何早日形成全国性的三板市场正在成为各方关注的焦点。借助“新三板”市场开通一周年的时机，北京中关村正在加紧酝酿对三板市场跨区域的更大发展。与此同时，最近上海市人大代表提出上海争建全国性三板市场的主张，以及天津申请建立三板市场已经得到有关部门会签的消息。

        08年召开的全国证券期货监管工作会议上，中国证监会主席尚福林明确指出，今年推进资本市场改革发展的任务之一，就是要推进多层次市场体系建设。

        所谓“多层次资本市场体系”，指的是交易所市场、场外市场、区域性市场、无形市场等多个层次的市场体系，用以满足不同层次的直接融资需求以及不同偏好的投资者需求。由于有关部门对于是否推出创业板仍存争议，建设全国性的场外交易市场有望先行一步。

        业内人士表示，三板市场即为场外交易市场，作为我国多层次资本市场体系的一个重要组成部分，它是主板市场和中小板市场的基础和前台。根据北京、上海和天津目前的思路，三大城市的目标大致相同，都是想建立连接主板市场和中小板市场的股权转让平台。

        “新三板”在中关村科技园区试点初显成效，已经引起了国内其他高新区的关注。中国证券业协会副秘书长邓映翎曾明确表示，中关村代办股份转让系统将扩大试点，逐步推广到其他52个高新区，成为全国统一的场外交易市场。有学者指出，仅从形式上而言，代办股份转让系统扩展到一定程度就是一个全国性的OTC市场。

        专家表示，像中关村这样由券商主办的代办股权转让，具有更好的价值发现功能，可以让有股权转让意向的非上市公司实现溢价发行，这与各种产权交易所、产权交易机构所进行的按股权净资产价格转让具有很大不同。